在初音岛上存在不可思议现象。本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。但两年之后，樱花再度在初音岛上绽放，主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅[好困]消失了，就像错觉般突然改变的。说到朋友的白河ことり、天枷美春、水越眞子几个人，现在过着和以前相同的日常生活。除了一个大的改变以外，那就是他的两个妹妹——朝仓音梦和芳乃樱——两个人在二年之后又回到了初音岛。音梦从护士学校毕业后成为了风见学院的保健医生，而芳乃樱从美国回来后成为了风见学园的教师。有一天，有一个少女来到初音岛，她的名字是爱西亚，为了向纯一的祖母学习魔法特意由遥远的北欧专程赶来，可是纯一……